La Corte Suprema, con el voto coincidente de sus cinco jueces, dejó firme el sobreseimiento que ya había sido anticipado en las instancias anteriores del proceso.
Berni fue denunciado penalmente por la Asociación de Ex Detenidos Desaparecidos por privación ilegítima de la libertad agravada.
Junto con Berni también fue sobreseído Horacio Orlando Molina, ex comandante mayor de Gendarmería Nacional.
El 30 de agosto de 2012, Berni encabezó un operativo para liberar la traza y, en ese marco, fueron detenidos varios manifestantes. Según el Poder Judicial, Berni actuó por orden de la jueza Sandra Arroyo Salgado y no se excedió en el cumplimiento de sus funciones.